Theo các quyết định có liên quan, ông Nguyễn Quốc Chính bị xử phạt tổng cộng 350 triệu đồng do vi phạm các quy định về bảo vệ môi trường tại hai trang trại lợn. Các hành vi vi phạm gồm: thực hiện không đầy đủ nội dung trong quyết định phê duyệt kết quả thẩm định báo cáo đánh giá tác động môi trường; tự ý lắp đặt hệ thống đường ống xả thải không qua xử lý ra môi trường; chôn, lấp, đốt chất thải rắn thông thường trái quy định; xả nước thải vượt quy chuẩn kỹ thuật.
Ngoài việc bị xử phạt tiền, ông Chính còn bị buộc tháo dỡ toàn bộ thiết bị xả thải không phép, bao gồm các hệ thống ống nhựa và công trình phụ trợ, đồng thời có trách nhiệm chuyển giao chất thải rắn cho đơn vị đủ điều kiện xử lý theo quy định.

Với hành vi vi phạm tương tự tại một trang trại chăn nuôi riêng, bà Lê Thị Phương bị xử phạt 660 triệu đồng. Đáng chú ý, cơ sở của bà Phương còn không có giấy phép môi trường theo quy định pháp luật. Căn cứ vào tất cả các vi phạm, trang trại này bị đình chỉ hoạt động trong thời gian bốn tháng rưỡi, tính từ ngày nhận quyết định xử phạt.
Tổng mức xử phạt đối với cụm trang trại của ông Nguyễn Quốc Chính và bà Lê Thị Phương là một tỷ không trăm mười triệu đồng. Mặc dù là vợ chồng, hai cá nhân trên đứng tên riêng trong hồ sơ pháp lý và giấy phép liên quan đến các cơ sở chăn nuôi tại xã Cẩm Tân.