Theo đó, Sở Công Thương chủ trì, phối hợp các sở, ngành và chính quyền địa phương xây dựng phương án giải tỏa chợ tự phát, lập kế hoạch duy trì trật tự sau giải tỏa, đề xuất cơ chế hỗ trợ và huy động nguồn lực xã hội hóa phát triển hệ thống chợ theo quy hoạch.
Chính quyền cơ sở chịu trách nhiệm chính trong việc tổ chức giải tỏa, quản lý giết mổ, xử lý nghiêm vi phạm và vận động người dân thay đổi thói quen tiêu dùng, không mua bán tại chợ tự phát.